Master mention bio-informatique parcours In silico drug design, molécules bioactives

Ce parcours forme des professionnels(les) du privé et du public, au niveau français mais aussi européen, acteurs de la recherche par des approches in silico dans le domaine de l'innovation thérapeutique et/ou orientés vers le développement de molécules pharmacologiques. Ce parcours propose l'ensemble des compétences complémentaires nécessaires au processus de recherche et de conception de nouvelles molécules thérapeutiques et de modélisation computationnelles des macromolécules et de leur partenaires médicaments. Les étudiants acquièrent les connaissances nécessaires sur les composés chimiques et les cibles thérapeutiques pour la compréhension et la prédiction de leurs interactions et de la modélisation des interactions « médicament-cible » à l'aide des outils in silico. Ils sont formés aux approches telles que la programmation, la chemoinformatique, les biostatistiques, le machine learning, le développement de scripts permettant de chainer des logiciels, la bioinformatique structurale, les méthodes de simulations de dynamique moléculaire, le criblage virtuel et docking mais aussi à l'application et combinaison de ces différentes méthodes lors de nombreux projets appliqués avec de logiciels de pointe du domaine.

Ce parcours inclut un semestre en chémoinformatique à l'université de Strasbourg, un semestre orienté sur les molécules bioactives à l'université degli studi di Milano. Le semestre 3 orienté sur les approches de drug design et de criblage à l ‘université de Paris et le semestre 4 est un stage d'initiation à la recherche, encouragé à l'étranger. De nombreux projets tutorés réalisés en groupe sont proposés en M2. Un des objectifs est que les étudiants soient capables d'utiliser un pipeline optimisé pour identifier de nouveaux inhibiteurs d'une cible donnée en combinant les différents outils et approches nécessaires. Ce parcours offre de formation à l'interface des Sciences du Vivant et de la Chimie par une formation avec de fortes implications dans le domaine de la Santé dont la clé de voûte est l'interdisciplinarité. Cette interdisciplinarité s'appuie sur des masters d'excellence de plusieurs universités françaises et européennes (Paris Diderot, Strasbourg, Degli studi di Milano), des équipes académiques et du privé d'excellence et la participation de nombreux spécialistes internationaux de différents pays. Ce parcours est formé des UEs suivantes : Semestre 3 (Université de Paris) Data analysis in drug design (8 ECTS) Analyse et dynamique moléculaire & drug design (7 ECTS) Criblage haut-débit :structure & ligand-based (5 ECTS) Analyse de l'espace des Molécules (4 ECTS) Préparation à la recherche en Drug Design (6 ECTS) Semestre 4 Stage (30 ECTS)