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Formation bioinformatique et metabarcoding

Date de mise à jour :
Identifiant Offre Info : 03_241218684F
Organisme responsable : Argaly (ouvre dans un nouvel onglet)

Nouvelle recherche

Présentation de la formation

Objectifs

- Comprendre les applications des analyses bioinformatiques pour le metabarcoding
- Maîtriser les outils bioinformatiques OBITools pour l'analyse de données de séquençage NGS
- Savoir générer ses tableaux de résultats taxonomiques à partir de données brutes de séquençage NGS

Programme de la formation

I. Notions de base : connexions, commandes, inputs et outputs
II. OBITools
III. Données brutes
IV. Traitement des données (démultiplexage, déreplication, filtrage basique, clustering)
V. Assignation taxonomique 
VI. Filtrage des données (metabaR)
VII. Manipulation sur un jeu de données réels
VIII. Session questions/réponses

Validation et sanction

Maîtrise des outils bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage NGS
 

Type de formation

Non certifiante

Niveau de sortie

Sans niveau spécifique

Durée, rythme, financement

Durée

En entreprise

7 h

Financement

Conventionnement
Non
Financeur
  • Entreprise

    Programme : Entreprise

Conditions d'accès

Public visé

  • Salarié

Niveau d'entrée

Sans niveau spécifique

Conditions spécifiques et prérequis

Aucun

Lieu de réalisation de l'action

Modalités d'enseignement

Formation entièrement en présentielle

Adresse

113 Montée de la grande marie
73370 Le Bourget-du-Lac

Responsable : Argaly

Périodes prévisibles de déroulement des sessions

Début

Fin

Adresse d'inscription
113 Montée de la grande marie
73370 Le Bourget-du-Lac
État du recrutement
Ouvert
Modalités
Entrées / Sorties à dates permanentes