Aller au contenu principal

ADN environnemental et metabarcoding

Date de mise à jour :
Identifiant Offre Info : 03_241218678F
Organisme responsable : Argaly (ouvre dans un nouvel onglet)

Nouvelle recherche

Présentation de la formation

Objectifs

- Evaluer le potentiel de l'ADN environnemental et ses champs d'applications
- Comprendre les différentes étapes de l'analyse metabarcoding (phase laboratoire et bioinformatique)
- Acquérir l'autonomie dans des projets requiérant des analyses metabarcoding (rédaction d'articles, manipulation de données ADNe, interprétation...)

Programme de la formation

I. Introduction a) Constats b) Histoire de la technique I. Principe de la technique a) Barcoding VS metabarcoding b) Potentiel c) Champs d'application d) Phases de travail III. Phase laboratoire a) Extraction d'ADN et test qPCR préliminaire b) Amplification PCR c) Vérification et contrôles qualité d) Préparation de la librairie de séquençage e) Séquençage NGS IV. Phase bioinformatique a) Données brutes b) Assemblage et premier filtrage c) Clustering d) Assignation…

I. Introduction
a) Constats
b) Histoire de la technique

I. Principe de la technique
a) Barcoding VS metabarcoding
b) Potentiel
c) Champs d'application
d) Phases de travail

III. Phase laboratoire
a) Extraction d'ADN et test qPCR préliminaire
b) Amplification PCR
c) Vérification et contrôles qualité
d) Préparation de la librairie de séquençage
e) Séquençage NGS

IV. Phase bioinformatique
a) Données brutes
b) Assemblage et premier filtrage
c) Clustering
d) Assignation taxonomique
e) Second filtrage

V. Session questions / réponses

Validation et sanction

Compréhension des concepts et étapes d'une analyse metabarcoding
Autonomie pour des projets impliquant des analyses metabarcoding

Type de formation

Non certifiante

Niveau de sortie

Sans niveau spécifique

Durée, rythme, financement

Durée

En entreprise

4 h

Financement

Conventionnement
Non
Financeur
  • Entreprise

    Programme : Entreprise

Conditions d'accès

Public visé

  • Salarié

Niveau d'entrée

Sans niveau spécifique

Conditions spécifiques et prérequis

Aucun

Lieu de réalisation de l'action

Modalités d'enseignement

Formation mixte

Adresse

113 Montée de la grande marie
73370 Le Bourget-du-Lac

Responsable : Argaly

Périodes prévisibles de déroulement des sessions

Début

Fin

Adresse d'inscription
113 Montée de la grande marie
73370 Le Bourget-du-Lac
État du recrutement
Ouvert
Modalités
Entrées / Sorties à dates permanentes