Master sciences, technologies, santé mention biologie, agronomie, santé spécialité modélisation de systèmes biologiques

L'objectif principal de ce master est de former des étudiants issus d'un cursus biologique, informatique ou mathématique, à la démarche intellectuelle et aux techniques de la modélisation en biologie.
Actuellement, que ce soit en génomique/post-génomique ou en écologie/environnement, les scientifiques sont confrontés à l'analyse de grandes masses de données soumises à des interactions multiples. Dans ce contexte, les modèles peuvent être un moyen de décrire et de comprendre des phénomènes complexes.

Compétences scientifiques générales

• Respecter l'éthique scientifique
• Connaître et respecter les réglementations
• Faire preuve de capacité d'abstraction
• Analyser une situation complexe
• Adopter une approche pluridisciplinaire
• Mettre en oeuvre une démarche expérimentale : utiliser les appareils et les techniques de mesure les plus courants ; identifier les sources d'erreur ; analyser et valider des données expérimentales; résoudre par approximations successives un problème complexe
• Utiliser des logiciels d'acquisition et d'analyse de données
• Utiliser des outils mathématiques et statistiques

Compétences disciplinaires spécifiques

• Maîtriser les concepts des principaux domaines de la Biologie : Génomique, Biologie Cellulaire et Moléculaire, Écologie, Environnement, Biologie des populations...
• Être capable de modéliser les données issues des principaux domaines de la Biologie
• Utiliser des logiciels de bioinformatique : construction phylogénétique, analyse de séquences et de structures, analyse de données en masse ...
• Manipuler les concepts principaux et utiliser les techniques courantes de la modélisation mathématique)
• Manipuler les tests statistiques de base
• Extraire et analyser les paramètres statistiques d'un ensemble de données
• Exploiter des logiciels de calcul scientifique
• Connaissance du langage R
• Modéliser des situations réelles ou des algorithmes en utilisant des outils formels de la logique
• Valider un modèle et en apprécier les limites
• Maîtriser au moins un langage de programmation (Python, Java, xml...)
• Maîtriser le principe du codage et du traitement de l'information
• Analyser un problème, concevoir et mettre en oeuvre des algorithmes pour le résoudre
• Réaliser la conception, l'implémentation et l'exploitation de bases de données orientées objet
• Maîtriser différents environnements de travail (Windows, Linux ...)
• Savoir évaluer et choisir une solution logicielle par rapport à un problème donné

Compétences transversales

• Travailler en autonomie : établir des priorités, gérer son temps, s'auto-évaluer, élaborer un projet personnel de formation
• Utiliser les technologies de l'information et de la communication
• Effectuer une recherche d'information : préciser l'objet de la recherche, identifier les modes d'accès, analyser la pertinence, expliquer et transmettre
• Mettre en oeuvre un projet : définir les objectifs et le contexte, réaliser et évaluer l'action
• Réaliser une étude : poser une problématique ; construire et développer une argumentation ; interpréter les résultats ; élaborer une synthèse ; proposer des prolongements
• Rédiger clairement, préparer des supports de communication adaptés, prendre la parole en public et commenter des supports
• Communiquer en langues étrangères
• Travailler en équipe : s'intégrer, se positionner, collaborer
• S'intégrer dans un milieu professionnel : identifier ses compétences et les communiquer, situer une entreprise ou une organisation dans son contexte socio-économique, identifier les personnes ressources et les diverses fonctions d'une organisation, se situer dans un environnement hiérarchique et fonctionnel, respecter les procédures, la législation et les normes de sécurité

Doctorat

Secteurs d'activité :

• la biologie
• la bioinformatique
• l'écologie et l'environnement

à chaque fois que des compétences complémentaires sont requises (modélisation, informatique, mathématique)

Métiers visés :

• Enseignant chercheur
• Cadre technique d'études scientifiques et de recherche fondamentale
• Cadre technique d'études-recherche-développement de l'industrie,
• Chargé d'études et de recherches agricoles et aquacoles
• Cadre technique de méthodes-ordonnancement-planification
• Cadre technique de l'environnement,
• Chargé de la protection du patrimoine naturel
• Chef de projet
• Ingénieur commercial