Master sciences, technologies, santé mention microbiologie, agrobiosciences et biologie des systèmes spécialité diagnostic microbiologique : approches innovantes

Les activités visées par le diplôme sont celles d'un cadre spécialisé de niveau Master (Bac+5) apte à intégrer des entreprises faisant appel à l'analyse microbiologique. Elles peuvent porter sur : la conception et le suivi de projets, la gestion des ressources biologiques, la gestion technique d'un laboratoire d'analyses, la veille technologique, la formation, le contrôle microbiologique industriel ou diagnostic clinique, vétérinaire ou végétal, la sécurité alimentaire, la traçabilité, l'analyses de l'eau et de l'environnement.

Compétences scientifiques spécifiques : connaissance et maitrise des concepts généraux en :

• microbiologie classique, moléculaire et cellulaire
• génomique
• virologie
• pathogénie microbienne humaine, animale et végétale
• écologie microbienne

Compétences techniques : connaissance des méthodologies et de l'instrumentation liés à:

• l'analyse par PCR en temps réel (qPCR)
• la conception, fabrication et utilisation de biopuces (ADN, protéines) à des fins de diagnostic
• l'électrophorèse (capillaire, en champs pulsés )
• la microscopie (épifluorescence, confocal à laser)
• la cytométrie en flux (FACS)
• l'immunotechnologie (ELISA)

Compétences transversales : maitrise des outils utilisés en :

• bioinformatique (recherche dans les banques de données, analyse et comparaison de séquences, définition de sondes et d'amorces)
• recherche bibliographique
• bio-statistiques (analyse statistique et interprétation de données expérimentales en biologie, validation de méthodes, numération)
• analyse d'images
• les normes, la réglementation des outils de diagnostic et de développement des technologies au sein de l'entreprise
• règlementation hygiène et sécurité microbiologique
• la gestion de la qualité
• maitrise de l'anglais

Compétences socio-économiques et managériales : connaissances dans les domaines de :

• l'organisation de l'entreprise
• la gestion de projet
• la propriété intellectuelle

Capacités attestées :

• Savoir rechercher et analyser la bibliographie et les informations scientifiques disponibles relatives au sujet étudié
• Savoir analyser et synthétiser des informations techniques sur un sujet
• Savoir concevoir, chiffrer, planifier dans le temps et mettre en oeuvre des projets dans le domaine du diagnostic microbiologique en prenant en compte l'environnement économique, social et humain
• Savoir établir et se conformer à un cahier des charges et à des protocoles méthodologiques rigoureux
• Savoir mettre en oeuvre des techniques de traitement statistique de données et de modélisation et savoir utiliser et mettre en oeuvre des outils et des logiciels informatiques adaptés
• Savoir communiquer de différentes façons (rapport écrit, communication orale et réalisation d'affiches)
• Savoir créer des réseaux de personnes compétentes sur un sujet et animer ce réseau

Les débouchés se situent en recherche et développement dans les secteurs agro-alimentaire, pharmaceutique, biomédical, vétérinaire, cosmétique et environnemental. Les emplois peuvent s'exercer à la fois au niveau local, national ou international dans des organismes ou entreprises relevant du secteur privé (multinationales ou start-up concevant et commercialisant des systèmes de diagnostic in vitro) ou du secteur public ou des collectivités territoriales (plateforme technologiques, laboratoires départementaux, instituts techniques, CRITT...) :

• contrôle qualité, technico-commercial, expertise et conseil.
• Ingénieur Recherche et Développement en entreprise et dans les centres techniques
• Ingénieur d'étude sur des plateformes technologiques
• Cadre spécialisé dans le contrôle microbiologique
• Conseiller et chargé de mission en ingénierie microbiologique
• Doctorant en recherche appliquée