Master mention bio-informatique (M2)

• Master mention bio-informatique - Code CertifInfo 116852
  • Niveau de qualification : 7 - Savoirs hautement spécialisés

Objectifs

Compétences transversales

• Identifier les usages numériques et les impacts de leur évolution sur le ou les domaines concernés par la mention


• Se servir de façon autonome des outils numériques avancés pour un ou plusieurs métiers ou secteurs de recherche du domaine


• Mobiliser des savoirs hautement spécialisés, dont certains sont à l'avant garde du savoir dans un domaine de travail ou d'études, comme base d'une pensée originale


• Développer une conscience critique des savoirs dans un domaine et/ou à l'interface de plusieurs domaines


• Résoudre des problèmes pour développer de nouveaux savoirs et de nouvelles procédures et intégrer les savoirs de différents domaines


• Apporter des contributions novatrices dans le cadre d'échanges de haut niveau, et dans des contextes internationaux


• Conduire une analyse réflexive et distanciée prenant en compte les enjeux, les problématiques et la complexité d'une demande ou d'une situation afin de proposer des solutions adaptées et/ou innovantes en respect des évolutions de la règlementation


• Identifier, sélectionner et analyser avec esprit critique diverses ressources spécialisées pour documenter un sujet et synthétiser ces données en vue de leur exploitation


• Communiquer à des fins de formation ou de transfert de connaissances, par oral et par écrit, en français et dans au moins une langue étrangère


• Gérer des contextes professionnels ou d'études complexes, imprévisibles et qui nécessitent des approches stratégiques nouvelles


• Prendre des responsabilités pour contribuer aux savoirs et aux pratiques professionnelles et/ou pour réviser la performance stratégique d'une équipe


• Conduire un projet (conception, pilotage, coordination d'équipe, mise en œuvre et gestion, évaluation, diffusion) pouvant mobiliser des compétences pluridisciplinaires dans un cadre collaboratif


• Analyser ses actions en situation professionnelle, s'autoévaluer pour améliorer sa pratique dans le cadre d'une démarche qualité


• Respecter les principes d'éthique, de déontologie et de responsabilité sociale et environnementale


• Prendre en compte la problématique du handicap et de l'accessibilité dans chacune de ses actions professionnelles

Compétences spécifiques

• Concevoir les traitements informatiques adaptés pour la résolution de questions biologiques liées à l'analyse de données complexes.


• Intégrer des sources variées de données et des résultats d'analyses informatiques, bioinformatiques et statistiques pour établir des associations entre les différents types de données afin de permettre leur interprétation par des biologistes.


• Mobiliser les concepts fondamentaux de biologie en lien avec l'informatique

Programme de la formation

Le M2 propose 420h d'enseignement sur 12 mois. Les enseignements viennent compléter et renforcer les trois blocs de compétences autour desquels est organisée la formation, et permettent aux étudiants de renforcer leurs softs skills notamment en matière de communication et de réglementation.

Bloc 1 : Analyser et modéliser les données biologiques II

• Génomique en Ecologie et Evolution 1 (obligatoire)


• Génomique en Ecologie et Evolution 2 (optionnel)


• Génomique en Ecologie et Evolution 3 (optionnel)


• Modélisation des réseaux métaboliques (optionnel)


• Introduction à la biologie des systèmes (optionnel)


• Biologie de synthèse (optionnel)


• Conception et criblage de molécules bioactives, drug design (optionnel)

Bloc 2 : Gérer et visualiser les données biologiques II

• Programmation web pour la bio-informatique (obligatoire)


• Visualisation de données biologiques (obligatoire)


• Bases de données non relationnelles(optionnel)


• Gestion de Grandes Masses de Données (optionnel)


• Intégration et Qualité des Données (optionnel)

Bloc 3 : Concevoir des méthodes/pipelines pour l'analyse de data II

• Algorithmique avancée pour la bio-informatique (obligatoire)


• Projet en bio-informatique 3 (obligatoire)


• Stage entreprise / laboratoire 2 (obligatoire pour les étudiants en formation initiale)


• Missions en milieu professionnel 2 (obligatoire pour les étudiants en alternance)


• Techniques d'apprentissage automatique (optionnel)


• Analyse de données (optionnel)


• Graphes, Complexité, Combinatoire (optionnel)


• Statistique bayésienne et applications (optionnel)


• Phylogénomique et évolution moléculaire (optionnel)

Soft skills :

• Droit logiciel, protection des données et bioéthique (obligatoire)


• Anglais pour la communication professionnelle (obligatoire)

Validation et sanction

Master mention bio-informatique

Type de formation

Certifiante

Sortie

Bac + 5 et plus