Master mention bio-informatique parcours développement logiciel et analyse des données

• Master mention bio-informatique - Code CertifInfo 105531
  • Niveau de qualification : 7 - Savoirs hautement spécialisés

Objectifs

• Collecter, intégrer et savoir structurer diverses sources de données biologiques hétérogènes et massives au sein d'une base de données en vue de leur exploitation.
• Décrire, structurer et résumer une grande quantité d'informations en mettant en oeuvre des tests, des prototypages et des analyses mathématiques et statistiques appropriés aux traitements de grands jeux de données soit pour aider à la prise de décision, soit pour proposer ou vérifier des hypothèses.
• Utiliser à un niveau expert des infrastructures de calcul intensif, se connecter à des clusters de calculs distants de manière sécurisée, administrer des postes de travail, installer et utiliser de nouveaux programmes.
• Concevoir les traitements informatiques adaptés à la résolution de questions biologiques liées à l'analyse de données complexes.
• Intégrer différentes sources de données et résultats d'analyses informatiques, bioinformatiques, mathématiques et statistiques variés pour établir des associations entre les différents types de données et permettre aux chercheurs et services R&D des entreprises de bioinformatique / biotechnologie d'interpréter en termes biologiques les processus et systèmes biologiques dans le cadre de recherches appliquées, translationnelles (santé) ou fondamentales.
• Utiliser, concevoir et développer des techniques de visualisation et de représentation des données biologiques, des connaissances, et des résultats d'analyse, ceci afin de faciliter la lecture synthétique, la diffusion de l'information et l'interprétation de données du domaine de la bio-information
• Maîtriser et appliquer la réglementation générale concernant la protection des données personnelles.
• Identifier les usages numériques et les impacts de leur évolution sur le ou les domaines concernés par la mention
• Se servir de façon autonome des outils numériques avancés pour un ou plusieurs métiers ou secteurs de recherche du domaine
• Mobiliser des savoirs hautement spécialisés, dont certains sont à l'avant-garde du savoir dans un domaine de travail ou d'études, comme base d'une pensée originale
• Développer une conscience critique des savoirs dans un domaine et/ou à l'interface de plusieurs domaines
• Résoudre des problèmes pour développer de nouveaux savoirs et de nouvelles procédures et intégrer les savoirs de différents domaines
• Apporter des contributions novatrices dans le cadre d'échanges de haut niveau, et dans

  Programme de la formation

  Ce diplôme est obtenu après la validation de 2 années, seule la dernière année est certifiante, il se compose comme suit : une première année de 488 heures en centre et 245 heures en entreprise, une deuxième année de 330 heures en centre et 840 heures en entreprise
  Compétences à acquérir
  Développer une approche pluridisciplinaire qui intègre les concepts et méthodes de biologie, d'informatique, de mathématiques et statistiques afin de décrypter les mécanismes présidant au fonctionnement et à l'évolution du vivant. Ceci inclura :
  savoir analyser des données génomiques de différentes nature pour en extraire l'information pertinente, et interpréter les résultats en termes de mécanismes biologiques ou d'applications (médecine, agriculture, biotechnologie) ;
  savoir élaborer des procédures reproductibles pour l'analyse analyses de données massives (“workflows”) ;
  savoir développer un outil informatique original suivant les bonnes pratiques du domaine (programmation collaborative, gestion des versions, documentation du code et des modes d'utilisation) ;
  s'exprimer et produire des rapports scientifiques en anglais.

  Validation et sanction

  Certification

  Type de formation

  Certifiante

  Sortie

  Bac + 5 et plus