Master mention bio-informatique parcours développement logiciel et analyse des données

• Master mention bio-informatique - Code CertifInfo 105531
  • Niveau de qualification : 7 - Savoirs hautement spécialisés

Objectifs

Les stagiaires acquerront une formation interdisciplinaire en biologie, informatique et statistique. Les applications biologiques incluront l'analyse de données génomiques, épigénomiques, transcriptomiques et protéomiques, évolutives, et des variations polymorphiques. La formation en informatique s'appuiera sur des cours de programmation, administration de systèmes, ingénierie logicielle, une formation aux bonnes pratiques pour la reproductibilité des résultats scientifiques, le développement de ressources bioinformatiques (bases de données, outils d'analyse) et le déploiement d'interfaces pour ces ressources. Les biostatistiques couvriront inférence statistique, analyse de données multidimensionnelles, modélisation des séquences et apprentissage automatique.
Pages web de la formation :
Générale : https://sciences.univ-amu.fr/fr/formation/masters/master-bio-informatique
Stages M1 : https://sciences.univ-amu.fr/en/master-1-bioinformatics-dlad-internship-proposals
Stages M2 : https://sciences.univ-amu.fr/en/master-2-bioinformatics-dlad-internship-proposals

Programme de la formation

Ce diplôme est obtenu après la validation de 2 années, seule la dernière année est certifiante, il se compose comme suit : une première année de 488 heures en centre et 245 heures en entreprise, une deuxième année de 330 heures en centre et 840 heures en entreprise
Compétences à acquérir
Développer une approche pluridisciplinaire qui intègre les concepts et méthodes de biologie, d'informatique, de mathématiques et statistiques afin de décrypter les mécanismes présidant au fonctionnement et à l'évolution du vivant. Ceci inclura :
savoir analyser des données génomiques de différentes nature pour en extraire l'information pertinente, et interpréter les résultats en termes de mécanismes biologiques ou d'applications (médecine, agriculture, biotechnologie) ;
savoir élaborer des procédures reproductibles pour l'analyse analyses de données massives (“workflows”) ;
savoir développer un outil informatique original suivant les bonnes pratiques du domaine (programmation collaborative, gestion des versions, documentation du code et des modes d'utilisation) ;
s'exprimer et produire des rapports scientifiques en anglais.

Validation et sanction

Certification

Type de formation

Certifiante

Sortie

Bac + 5 et plus