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DU séquençage haut débit

Objectifs, programme, validation de la formation
Objectifs :
Cette formation vous permet :D'acquérir une formation en séquençage
haut débit appliqué aux maladies génétiques mendéliennes, des technologies de
séquençage et approches expérimentales possibles aux outils bioinformatiques
utilisés pour le traitement des données brutes, l'identification de variations
génétiques et l'interprétation des résultats.De se familiariser avec le système
Unix/Linux, la ligne de commande et la gestion et l'analyse de données sur un
serveur à distance.De connaitre et savoir utiliser les
principaux logiciels dédiés à l'analyse de données de séquençage haut débit, de
l'alignement des séquences brutes à l'annotation de variations génétiquesDe maîtriser les principaux navigateurs,
bases de données et outils de prédiction couramment utilisés en génétique
humaine et médicale.De connaître les différentes
applications possibles du séquençage haut débit pour le diagnostic de maladies
génétiques, les principales règles à suivre et paramètres à considérer pour
assurer la qualité des données produites dans un contexte de laboratoire
médical, et les considérations éthiques que soulève le séquençage haut débit
pour l'interprétation et le rendu des résultats.

Programme de la formation :
Le volume horaire de ce diplôme est de 105 heures, réparties sur 5 modules de 21 heures (sur 3 jours) :
Module 1 :
Séquençage nouvelle génération - Technologies et applications (théorique).Module
2 : Introduction à Linux et à la programmation (pratique).Module 3 : Analyse de
données de séquençage haut débit (pratique).Module 4 : Bases de données, outils
de prédiction in silico et analyses approfondies (pratique et théorique).Module
5 : Séquençage haut débit et diagnostic - Exemples d'applications, qualité,
rendu des résultats et considérations éthiques (théorique).

Validation et sanction :
La formation est sanctionnée par un Diplôme d'Université habilité par l'université de Bourgogne.Le contrôle des connaissances est sanctionné à la fin de la formation par une épreuve écrite (QCM, épreuve de 2h).

Type de formation : Perfectionnement, élargissement des compétences

Niveau de sortie : niveau I (supérieur à la maîtrise))

Durée, rythme, financement
Durée : 105 heures totales
105 heure.

Conventionnement : Non

Frais restants à la charge du stagiaire : 1100

Conditions d'accès
Public(s) : Public de la formation initiale, Public en emploi, Salarié, Tout public

Niveau d'entrée : niveau I (supérieur à la maîtrise))

Conditions spécifiques et prérequis :
Publics et prérequis,Généticiens,Médecins biologistes en génétique moléculaire,Ingénieurs en génétique humaine-médicale,Étudiants et stagiaires post-doctoraux de ces disciplines.Ce diplôme est ouvert à la formation initiale et à la formation continue.

Lieu de réalisation de l'action
7 BOULEVARD JEANNE D'ARC
21000 Dijon
Responsable : UNIVERSITE DE BOURGOGNE - UMDPCS - UFR DES

Téléphone fixe : 03 80 39 34 96
Site web : http://sefca-umdpcs.u-bourgogne.fr/


Contacts
Contacter l'organisme formateur :
UNIVERSITE DE BOURGOGNE - SERVICE COMMUN DE FORMATIONS CONTINUE ET PAR ALTERNANCE (SEFCA)
SIRET : 19211237300589
ESPLANADE ERASME MAISON DE L'UNIVERSITE
21000 Dijon
Téléphone fixe : 03 80 39 51 80
Fax : 03 80 39 51 85
Site web : http://sefca.u-bourgogne.fr



Périodes prévisibles de déroulement des sessions
Du 07/10/2019 au 13/05/2020
Du 08/10/2018 au 15/05/2019
Organisme responsable
UNIVERSITE DE BOURGOGNE - SERVICE COMMUN DE FORMATIONS CONTINUE ET PAR ALTERNANCE (SEFCA)
SIRET : 19211237300589

ESPLANADE ERASME
MAISON DE L'UNIVERSITE
21000 Dijon
Téléphone fixe : 03 80 39 51 80
Fax : 03 80 39 51 85
Site web : http://sefca.u-bourgogne.fr


Date de mise à jour : 17/07/2018, Ref : 10_21581
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